Program Studi Pendidikan Matematika yang didirikan pada tanggal 22 Mei 1986 merupakan program studi ketiga yang ada di lingkungan Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan (FKIP) yang saat ini berubah nama menjadi Fakultas Pendidikan dan Sains (FPS) setelah Program Studi Pendidikan Bahasa Idan Sastra ndonesia dan Program Studi Pendidikan Bahasa Inggris. Sejak berdirinya Prodi Pendidikan Matematika telah dipimpin oleh enam orang Ketua Program Studi, yaitu:

1. Sri Kustini, Dra. (1986 – 2001)
2. Dr. H. Ena Suhena Praja, Drs., M.Pd. (2001 – 2009)
3. Tonah, M.Si. (2011 – 2014)
4. Dr. Cita Dwi Rosita, M.Pd. (2014 – 2020)
5. Dr. Surya Amami Pramuditya, M.Si. (2020-2021)
6. Dr. Moch. Subali Noto, M.Pd. (2021-2023)

Saat ini Prodi Pendidikan Matematika dipimpin oleh Dr. Hj. Neneng Aminah, M.Pd sebagai ketua program studi. Prodi Pendidikan Matematika telah terakreditasi BAN-PT dengan SK No. 4618/SK/BAN-PT/Akred/S/VIII/2020 dengan nilai Akreditasi “B”.